Santos

Sinh ra và lớn lên tại thành phố Santos, Emerson trải qua các cấp bậc của lò đào tạo câu lạc bộ Santos trước khi ra mắt đội một vào năm 2011 khi 16 tuổi.[1] Ngày 17 tháng 6 năm 2013, Emerson có trận đấu đầu tiên tại Giải bóng đá vô địch quốc gia Brasil, trong trận thua 1-0 trước Flamengo.[2] Bàn đầu tiên của anh cho Santos là trong trận thua 1-2 trước Atlético Paranaense ngày 5 tháng 9 năm 2013.

Palermo

Đội bóng Ý Palermo mượn Emerson từ Santos kèm điều khoản mua đứt trong mùa bóng 2014-15.[1] Tuy nhiên anh chỉ có 9 lần ra sân ở Serie A cho Palermo trong suốt mùa giải.[3]

AS Roma

Ngày 31 tháng 8 năm 2015, Emerson gia nhập Roma theo thỏa thuận cho mượn có thời hạn một năm.[4]

Emerson có bàn thắng đầu tiên trên đất Ý trong trận thắng 3-1 trước Milan ngày 14 tháng 5 năm 2016.[5] Đến ngày 7 tháng 7, Roma quyết định mượn anh thêm một mùa giải nữa.[6] Ngày 5 tháng 12 năm 2016, Roma quyết định mua đứt Emerson từ Santos với phí chuyển nhượng 12 triệu €.[7]

Emerson đã không thể ra sân trong nửa đầu mùa giải 2017-18 vì chấn thương dây chằng chéo trước mà anh gặp phải vào tháng 5 năm 2017.[8] Ngày 1 tháng 12 năm 2017, anh ra sân trở lại lần đầu tiên sau chấn thương trong 15 phút cuối trận đấu với SPAL tại Serie A.[9]

Chelsea

Ngày 30 tháng 1 năm 2018, Emerson gia nhập đội bóng Anh Chelsea theo bản hợp đồng có thời hạn 4 năm rưỡi với phí chuyển nhượng vào khoảng 17,6 triệu £.[10] Anh có trận đấu đầu tiên cho Chelsea trong trận đấu với Hull City tại vòng 5 Cúp FA, và đã ngay lập tức có dấu ấn với một đường chuyền thành bàn cho tiền đạo Olivier Giroud trong chiến thắng 4–0 tại Stamford Bridge.[11]

Emerson có trận đấu đầu tiên tại Premier League vào ngày 4 tháng 3 năm 2018 khi vào sân từ ghế dự bị trong trận thua Manchester City 1-0. Anh được đá chính lần đầu tại Premier League trong trận đấu với Burnley vào ngày 19 tháng 4. Từ đường chuyền của Emerson, Victor Moses đã ấn định chiến thắng 2-1 cho Chelsea.[12]

Ngày 26 tháng 9 năm 2018, trong lần đầu tiên ra sân tại mùa giải 2018–19, Emerson đã có bàn thắng đầu tiên trong màu áo Chelsea, gỡ hòa 1-1 trước Liverpool trước khi Chelsea lội ngược dòng thắng 2-1 tại vòng ba Cúp EFL.[13] Ngày 24 tháng 2 năm 2019, anh có mặt trong đội hình xuất phát trận Chung kết Cúp EFL 2019 với Manchester City và là một trong những cầu thủ Chelsea thực hiện thành công loạt sút luân lưu nhưng Manchester City mới là đội chiến thắng sau cùng.[14] Ngày 29 tháng 5 năm 2019, anh là người có đường chuyền để Olivier Giroud đánh đầu mở tỉ số trận Chung kết UEFA Europa League 2019 gặp Arsenal. Chelsea giành chiến thắng 4-1 chung cuộc và đây là danh hiệu đầu tiên Emerson có được cùng đội bóng Anh.[15]